OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-SuperClinical-141M
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-SuperClinical-141M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-SuperClinical-141M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature...
Thành tựu nổi bật
Những danh hiệu mới nhất của dự án
#1 Repository Của Tháng
#1 Repository Của Tháng
#1 Repository Của Tháng
🧬 Mô hình NER nhận dạng thực thể hóa học trong văn bản y sinh
Mô hình fine-tune trên DeBERTa-v2, tối ưu cho trích xuất tên hóa chất trong văn bản y học.
OpenMed-NER-ChemicalDetect-SuperClinical-141M là một mô hình transformer được fine-tune chuyên dụng cho nhiệm vụ nhận dạng thực thể hóa học (Chemical Entity Recognition) trong văn bản y sinh. Dựa trên kiến trúc DeBERTa-v2, mô hình này được huấn luyện trên bộ dữ liệu BC4CHEMD — một bộ dữ liệu được chú thích thủ công từ các trừu chương PubMed theo hướng dẫn ChEBI — nhằm hỗ trợ các ứng dụng như phát hiện tương tác thuốc, trích xuất thuốc từ hồ sơ bệnh nhân, giám sát tác ứng phụ, và khai thác văn bản cho nghiên cứu thuốc.
✨ Điểm nổi bật
- F1 Score 0.93: Hiệu suất cao trên bộ chuẩn BC4CHEMD
- Fine-tune trên DeBERTa-v2: Kiến trúc mạnh mẽ cho NLP y sinh
- Hỗ trợ 2 nhãn thực thể:
B-CHEMvàI-CHEM - Tích hợp Hugging Face Transformers: Dễ dàng triển khai qua pipeline
- Huấn luyện trên BC4CHEMD: Bộ dữ liệu chuẩn từ BioCreative IV
- Xuất bản trên arXiv: Liên kết với nghiên cứu 2508.01630
💡 Vì sao đáng chú ý
Mô hình nằm trong hệ sinh thái OpenMed, nơi cung cấp nhiều phiên bản khác nhau tùng theo kích thước và nguồn dữ liệu huấn luyện (PubMed, SnowMed, SuperClinical...). Phiên bản 141M này là lựa chọn nhẹ nhất, phù hợp triển khai trên môi trường có tài nguyên hạn chế nhưng vẫn đạt độ chính xác cao. Mô hình hỗ trợ ngay qua API Hugging Face, dễ dàng tích hợp vào pipeline xử lý văn bản y học.
#NER #BiomedicalNLP #ChemicalEntityRecognition #DeBERTa #HuggingFace #OpenMed #DrugDiscovery #TiniX
Dự án tương tự
Khám phá các dự án và mô hình AI khác có sự tương đồng.
all-MiniLM-L6-v2 This is a sentence-transformers(https://www.SBERT.net) model: It maps sentences & paragraphs to a 384 dimensional dense vector space and can be used for tasks like clustering or semantic search. Usage (Sentence-Transformers) Using t...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-SuperClinical-434M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-SuperClinical-434M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.io/...
Cross-Encoder for MS Marco This model was trained on the MS Marco Passage Ranking(https://github.com/microsoft/MSMARCO-Passage-Ranking) task. The model can be used for Information Retrieval: Given a query, encode the query will all possible passages...
sentence-transformers/paraphrase-multilingual-MiniLM-L12-v2 This is a sentence-transformers(https://www.SBERT.net) model: It maps sentences & paragraphs to a 384 dimensional dense vector space and can be used for tasks like clustering or semantic se...
BERT base model (uncased) Pretrained model on English language using a masked language modeling (MLM) objective. It was introduced in this paper(https://arxiv.org/abs/1810.04805) and first released in this repository(https://github.com/google-resear...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-BigMed-278M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-BigMed-278M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.io/badge/License-...
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature !License...
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-395M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-395M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature !License...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-ModernClinical-149M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-ModernClinical-149M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.i...