OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature !License...
Thành tựu nổi bật
Những danh hiệu mới nhất của dự án
#1 Repository Của Tháng
#1 Repository Của Tháng
#1 Repository Của Tháng
🧬 Mô hình NER hóa chất y sinh CompactMed-149M
Nhận diện hợp chất và chất hóa học trong văn bản y sinh với F1 0.92 trên BC4CHEMD.
OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-149M là mô hình token classification dựa trên ModernBERT 149M, fine-tune trên BC4CHEMD để nhận diện thực thể hóa chất (B-CHEM, I-CHEM) trong tài liệu y sinh. Phù hợp trích xuất thuốc, theo dõi sự kiện bất lợi, khai thác tài liệu cho khám phá thuốc và xây dựng knowledge graph.
✨ Điểm nổi bật
- Nhận diện hóa chất: Trích xuất tên hợp chất và chất hóa học từ văn bản y sinh.
- Kiến trúc ModernBERT 149M: Mô hình gọn nhẹ, tương thích Hugging Face Transformers.
- Đào tạo BC4CHEMD: Corpus chuẩn BioCreative IV cho chemical NER.
- Hiệu năng tốt: F1 0.92, precision 0.91, recall 0.93, accuracy 0.98.
- Dễ tích hợp: Dùng pipeline Transformers với aggregation_strategy simple.
- Apache 2.0: License mở, dùng production.
💡 Vì sao đáng chú ý
Mô hình tập trung vào hóa chất nên nhẹ hơn các variant PubMed lớn hơn nhưng vẫn đạt hiệu năng tốt cho tác vụ chuyên biệt. Phù hợp pipeline tự động trích xuất hóa chất từ abstract và tài liệu lâm sàng.
#NER #BiomedicalNLP #ChemicalEntityRecognition #OpenMed #TiniX
Similar Projects
Discover other similar projects and AI models.
all-MiniLM-L6-v2 This is a sentence-transformers(https://www.SBERT.net) model: It maps sentences & paragraphs to a 384 dimensional dense vector space and can be used for tasks like clustering or semantic search. Usage (Sentence-Transformers) Using t...
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-395M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-ModernMed-395M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature !License...
Cross-Encoder for MS Marco This model was trained on the MS Marco Passage Ranking(https://github.com/microsoft/MSMARCO-Passage-Ranking) task. The model can be used for Information Retrieval: Given a query, encode the query will all possible passages...
sentence-transformers/paraphrase-multilingual-MiniLM-L12-v2 This is a sentence-transformers(https://www.SBERT.net) model: It maps sentences & paragraphs to a 384 dimensional dense vector space and can be used for tasks like clustering or semantic se...
BERT base model (uncased) Pretrained model on English language using a masked language modeling (MLM) objective. It was introduced in this paper(https://arxiv.org/abs/1810.04805) and first released in this repository(https://github.com/google-resear...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-SuperClinical-434M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-SuperClinical-434M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.io/...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-BigMed-278M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-BigMed-278M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.io/badge/License-...
🧬 OpenMed-NER-PharmaDetect-ModernClinical-149M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-PharmaDetect-ModernClinical-149M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Chemical entities from the BC5CDR dataset !License(https://img.shields.i...
🧬 OpenMed-NER-ChemicalDetect-MultiMed-568M(https://huggingface.co/OpenMed/OpenMed-NER-ChemicalDetect-MultiMed-568M) Specialized model for Chemical Entity Recognition - Identifies chemical compounds and substances in biomedical literature !License(h...